Trường Đại học FPT hiện có 5 phân hiệu gồm Hà Nội, Đà Nẵng, Quy Nhơn, TP. HCM và Cần Thơ.
Trường Đại học FPT Hà Nội nằm ở Khu Công nghệ cao Hòa Lạc, Hà Nội, trên tổng diện tích 30 ha. Tòa nhà hiệu bộ của trường với 7 tầng có tổng diện tích sử dụng 11.065 m là công trình thiết kế giành giải Nhất kiến trúc xanh Việt Nam của KTS Võ Trọng Nghĩa và được vinh danh tại Festival Kiến trúc thế giới. Trường có khu ký túc xá dành cho sinh viên đang học tập và các cán bộ đang làm việc tại Hòa Lạc. Hiện có 6 khối nhà ký túc xá (tương ứng 6 DOM): A, B, C,D, E, F với các phòng ở là một không gian được thiết kế tiêu chuẩn, nhằm phục vụ cho nhu cầu sinh sống và học tập, làm việc của sinh viên và cán bộ. Các phòng học có thiết kế hiện đại và được trang bị hệ thống máy chiếu. Ngoài các phòng học dạng truyền thống, tại các khu học đường còn có phòng máy, các phòng học chức năng dành cho bộ môn thiết kế đồ họa và nhạc cụ dân tộc; kết hợp hệ thống thư viện và khu tự học nhằm phục vụ tốt nhất cho việc học của sinh viên.
Tại TP. HCM, Trường Đại học FPT hiện có các địa điểm đào tạo tại Khu Công nghệ cao TP.HCM, Quận 3, Quận Tân Bình, Quận Bình Thạnh và TP Thủ Đức. Trụ sở chính của Phân hiệu tại TP. HCM đang được đầu tư xây dựng tại Khu đô thị Tây Bắc TP. HCM (Củ Chi).
Khu Công nghệ cao TP.HCM là nơi tập trung các công ty công nghệ cao như Intel (USA), Nidec (Japan), … và các trung tâm nghiên cứu khoa học, kỹ thuật hiện đại. Trung tâm (campus) đào tạo và nghiên cứu của trường ĐH FPT tại đây rộng hơn 22 ngàn m2, nổi bật với kiến trúc độc đáo, được thiết kế bởi kiến trúc sư Võ Trọng Nghĩa, được đánh giá là campus xanh độc đáo bậc nhất TP.HCM.
Trường Đại học FPT Đà Nẵng được xây dựng trên lô đất 5.1 ha tại khu đô thị FPT Đà Nẵng với thiết kế thành một không gian xanh, bền vững cho tòa nhà. Từ đỉnh núi Ngũ Hành Sơn nhìn xuống, trường như bức tranh hài hoà giữa những đường nét trẻ trung, hiện đại tạo nên một không gia năng động, tràn đầy sức sống.
Trường Đại học FPT AI Quy Nhơn, toạ lạc tại Khu đô thị mới An Phú Thịnh, Phường Nhơn Bình & Phường Đống Đa, TP. Quy Nhơn, Bình Định. Đây là công trình nằm trong dự án Nghiên cứu – Thương mại hoá – Đào tạo về Trí tuệ nhân tạo quy mô lớn của tập đoàn FPT. Đại học FPT Quy Nhơn có thiết kế lấy cảm hứng từ các bo mạch điện tử – một hình ảnh đậm chất công nghệ, đồng thời các khối công trình cũng được sắp xếp dựa trên sự tối ưu công năng và không gian sử dụng. Tổ hợp công trình toạ lạc gần trung tâm thành phố Quy Nhơn bên bờ biển xanh mát, đem lại cảm hứng học tập.
Sự có mặt của Trường Đại học FPT ở trong khu công nghệ cao/công viên phần mềm của các thành phố lớn này thể hiện chiến lược đồng hành phát triển công nghiệp phần mềm của Tập đoàn FPT, cũng đồng thời mở ra triển vọng nghề nghiệp thanh niên tại các đô thị lớn nhất Việt Nam. Việc này giúp sinh viên có nhiều cơ hội thực tập khi đang theo học và dễ xin việc khi ra trường.
